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第九屆功能磁共振影像(fMRI)培訓班現正接受報名

發布時間:2013-09-11瀏覽數:3587

各位新老學員:
大家好!
 
      美德醫療在大家的支持和鼓勵下,不斷推出新的培訓課程,多年來連續舉辦各類fMRI培訓班,至今已經第九屆了,為各學科人才在科研工作中提供學習和交流等資源共享平臺,得到了業內人士的高度肯定,fMRI的培訓班已經日趨常規和系統化,每年都會舉辦至少兩期。其中我們很多學員都學有所成,取得了驕人的成績,我們也倍感欣慰。經過和學員以及幾位授課專家總結經驗,以后的培訓將以專題為目標,深入細致講解各種技術的原理和應用。本次培訓班將以深入學習靜息態fMRI技術和多模態融合方法,聘請研究領域最優秀的講師團隊,培訓班將保留往屆非常受歡迎的數據處理解析,科研思路講解,學員的互動討論環節,使得課程更加實用,也為學員中科研人才和臨床醫生合作搭建橋梁,希望我們在金秋時節一起收獲新的知識。
 
現就報名有關事宜說明如下:
 
1. 培訓班報到時間為11月21日下午6:00前,晚上開始上課,精彩不容錯過。
 
2. 為便于會務安排,報名時請按照回執表認真填寫并email給會務組。由于報名名額有限,請學員盡早報名,盡量用電匯的方式提前轉帳確認,現場不能刷卡繳費。
 
3.  希望參加發言討論的學員請盡快報名,將研究摘要以poster形式發給會務組。所有墻報經專家評選出口頭報告5-10個,口頭報告之后,同時參加poster交流。具體內容可以是已經發表的文章、未發表的初步研究結果,甚至僅僅是研究設計。墻報寬度90厘米,高度120厘米。墻報交流過程中,所有授課專家全程參與,以保證專家與學員、學員與學員的充分交流。
 
 
附:數據處理軟件操作培訓班調研表:
 
      美德醫療將聯手多個研究單位,并依托香港中文大學深圳研究院醫學影像研究培訓中心,建立數據處理培訓中心,配置超高速處理工作站,用于多種fMRI技術所需要的軟件上機操作培訓。我們將不定期根據報名和需求情況開辦實操培訓,聘請專業的講師和博士研究生團隊按步驟演示軟件的運行,為了了解大家對各軟件學習的需求,我們特列出了可能需要學習的各種軟件,希望先做一個摸底調查,根據大家的需求權重高低開設課程。請各位學員認真填寫并email給會務組。
 
感謝大家對美德醫療的支持,我們將一如既往地堅持培訓工作,為大家帶來持續學習的機會和專家交流的良好平臺。
 
順祝大家中秋國慶節日快樂,合家團圓!
 
美德醫療
 
2013年9月






第九屆功能磁共振影像(fMRI)培訓班
              --- 靜息態fMRI技術及應用專題
  中國·北京 2013.11.21 – 11.24

主辦單位:
 北京中科美德醫療信息科技有限公司
                   深圳市美德醫療電子技術有限公司
                                      
講師單位:   北京師范大學認知神經科學與學習國家重點實驗室
                   杭州師范大學認知與腦疾病研究中心
                   中國科學院心理研究所
                   臺灣長庚大學醫學院
                   耶魯大學醫學院
 
1.    研討會簡介
      功能磁共振影像(fMRI)近年來的發展日新月異,已成為研究認知和臨床腦疾病的重要技術。靜息態功能磁共振成像(Resting-State fMRI)作為研究靜息下人腦自發腦功能活動的重要手段,近十年來得到了快速發展,特別是與之相關的數據分析方法如研究腦區局部特征的方法(ReHo, ALFF等)和研究腦區之間關系的網絡分析(Brain network Analysis)等。利用靜息態fMRI技術,研究人員能夠獲取腦局部活動、功能連接、腦網絡屬性等多維度信息,為全面深入了解認知的神經機制以及神經精神疾病如精神分裂癥、老年癡呆癥、兒童注意缺陷多動障礙、癲癇、中風、腦外傷等臨床問題的神經生理病理學機制提供了重要幫助。
      本次培訓班的宗旨是讓學員們能夠深入了解靜息態fMRI技術在國際、國內的最新進展,掌握靜息fMRI的基本原理,了解相關的實驗設計、影像采集、數據處理、結果解釋等方面的知識, 為做出高水平的研究工作提供幫助。本培訓班將結合實例,重點介紹靜息態fMRI在認知研究和臨床實驗設計所需要的基本要素以及數據處理相關的統計方法。此外,培訓班還將講授靜息態fMRI論文寫作中的技巧和注意事項。
本次培訓班主要包含三方面內容:
  • 由諸多著名專家學者介紹靜息fMRI新技術的基本原理、實驗設計、數據分析的最新進展。專家學者結合自身研究方向, 講解靜息fMRI在認知和臨床腦疾病研究中的應用。
 
  • 延續以往培訓中備受歡迎的“Panel Discussion”環節,全體講師齊聚講臺,針對靜息態fMRI領域中的熱點話題以及學員現場的提問,闡述各自不同觀點和經驗,與大家分享科研心得。
 
  • 由專家學者講解靜息態fMRI科學論文的寫作。專家學者將會用親身經驗解悟靜息態fMRI相關論文寫作的要點和難點, 并且結合自己已發表的論文作為范例,講解從起草到發表的具體過程。
 
  • 由學員以墻報或口頭的形式報告自己的研究方向(自愿參與),并由專家學者做點評。對該活動感興趣的學員,請提前15天將摘要以poster形式發給會務組。所有墻報經專家評選出口頭報告2-3個,口頭報告之后,同時參加poster交流。具體內容可以是已經發表的文章、未發表的初步研究結果,甚至僅僅是研究設計。墻報寬度90厘米,高度120厘米。墻報交流過程中,所有授課專家全程參與,以保證充分的專家與學員、學員與學員的交流。此次培訓班側重臨床應用,面向所有與腦疾病相關的臨床醫生以及認知神經科學領域的相關研究人員,大家一定會獲益匪淺。
         在金秋時節,在首都北京,我們熱忱期待您的光臨!
 
 
2.    授課專家
      臧玉峰,1984年于河北醫學院醫學系獲醫學學士學位、1991年于天津醫學院獲神經外科學碩士學位、2002年于北京大學獲精神病學博士學位?,F任杭州師范大學認知與腦疾病研究中心教授。曾從事神經外科工作十余年。近十幾年來一直從事靜息態功能磁共振計算方法及其在腦疾病的應用研究。合作發表英文論文約90多篇,被SCI引用共3000多次(其中,2012年全年被引用約1000次)。與同事一道,提出了“局部一致性”(Zang et al., 2004, NeuroImage)和“低頻振幅”(Zang et al., 2007, Brain Dev)方法。帶領研究組開發了針對靜息態fMRI的數據處理軟件包REST和“流水線”式軟件包DPARSF。國際上引用這些軟件的英語論文約200篇。目前帶領的研究團隊包括張寒研究員、廖偉研究員、劉東強副研究員、廖旭紅副研究員等人,并與多家單位合作,開展靜息態fMRI方法學及其在腦疾病的應用研究,如神經反饋、癲癇、術前術中功能定位、DBS和TMS靶點定位、注意缺陷多動障礙、自發記憶鞏固與記憶障礙等。
 
      賀永,博士,國家杰出青年基金獲得者,北京師范大學認知神經科學與學習國家重點實驗室研究員(PI),兼任IDG/麥戈文腦科學研究所研究員(PI),博士生導師。目前兼任山東大學、首都醫科大學等國內外10余所高校、醫院、省部級實驗室兼職教授、專家、學術委員等。2005年在中科院自動化研究所獲博士學位。2005年至2007年在加拿大麥基爾(McGill)大學蒙特利爾神經學研究所從事博士后研究。2008年回國在北京師范大學認知神經科學與學習國家重點實驗室工作,擔任“計算神經影像與人腦連接組”團隊學術帶頭人。先后主持國家杰出青年基金、國家自然科學基金重點項目、北京市自然科學基金等多項國家和省部級課題?,F任國際期刊《Frontiers in Human Neuroscience》、《PLoS ONE》和《Brain Connectivity》編委,美國阿爾茨海默病協會、荷蘭阿爾茨海默病協會、法國國家研究署、英國哈德溫博士人道研究基金會、國家自然科學基金委等10余個國內外機構的基金評審專家,以及Am J Psychiatry, Ann Neurol, Brain, J Neurosci等30余個國際期刊論文評審人。在PNAS, Brain, Biol Psychiatry, J Neurosci等本領域主流期刊共發表SCI論文105篇,SCI總引用3400余次,H指數28。2009年和2011年獲Scopus青年科學家獎(生命科學領域)和國際心理科學聯合會APS Observer新星獎。帶領團隊開發腦網絡分析和可視化軟件包Gretna和BrainNet Viewer。主要研究領域為計算神經影像與人腦連接組學。詳細介紹,請參考http://psychbrain.bnu.edu.cn/teachcms/heyong.htm。
 
     畢彥超,北京師范大學認知神經科學與學習國家重點實驗室、IDG/McGovern Institute for Brain Research 研究員、團隊帶頭人(Principal Investigator)。于2006年獲哈佛大學心理學系腦、認知、行為專業博士學位。作為首席科學家主持973計劃青年項目,是國家自然科學基金委優秀青年基金獲得者,擔任北京神經科學學會理事。主要圍繞語言和語義記憶的認知神經基礎進行研究,作為通訊作者在Brain, Journal of Neuroscience、Cortex、NeuroImage、Brain and Language等國際心理學和神經心理學雜志發表多篇論文。曾獲Sackler Scholars Programme in Psychobiology獎項和國際心理科學聯合會新星獎。
 
      劉鶴齡,教授,博士,臺灣長庚大學醫學院,醫學影像暨放射科學系教授,臺灣長庚醫院放射診療部特聘顧問。畢業于臺灣清華大學物理系,2000年于美國德州大學獲醫學物理博士,從事血液灌注之計算方法與fMRI的技術研究。完成博士學位后返回臺灣工作,與臨床放射科、神經內外科、復建科、精神科、眼科及中醫多位醫師專家合作,進行磁共振臨床研究課題,并持續與大陸及香港多位杰出心理學家合作,在神經科學領域有新的探索。目前共發表有70余篇SCI論文,并為NeuroImage, Human Brain Mapping, MRM, JMRI等知名期刊審稿。2004年獲RSNA/AAPM資助至德州安德森癌癥中心完成一年臨床影像物理Residency訓練,并通過考試獲美國放射??疲ˋBR)認可診斷醫學物理師資格。2010年至加州大學圣地亞哥分校Center for Functional MRI半年,研習最新的ASL技術,期望將之推廣于臨床研究。
 
      王菲,醫學博士,耶魯大學醫學院精神科助理教授。主要研究興趣為多模態影像學在重性精神疾病中的應用。在精神醫學,神經科學以及影像醫學雜志(American Journal of Psychiatry, Biological Psychiatry, Brain等)發表SCI論文近50篇。先后獲得NIMH職業發展獎 K01, 兩次NARSAD青年研究員獎, Klingenstein Fundation 青年研究員獎。為20多個國際雜志審稿,并參加中國國家自然科學基金委、美國National Institute of Healthy、以及英國Medical Research Council等基金的評審。
 
      左西年,博士(應用數學),中國科學院心理研究所研究員,博士生導師,中科院“百人計劃”入選者,國際“千人功能連接組計劃”方法學支撐,國際“神經影像數據聯盟”咨詢團成員。主要研究領域為人腦功能連接組學及其應用,主要研究方向:1)靜息態功能磁共振計算方法及其重測信度,2)人腦功能連接組發展軌線。最近五年在國際學術期刊發表學術論文50篇,其中13篇為第一和/或通訊作者,13篇發表在神經影像方法學領域國際最高水平的雜志NeuroImage上,被引1178次(他引1076次),年均引用236次,H指數18。第16屆國際人腦成像年會做大會口頭報告(2010),獲NeuroImage解剖與生理編輯選擇獎(2010),受邀在劍橋大學“網絡與連接組論壇”做1小時報告(2012)?,F任國際期刊《公共科學圖書館-綜合》(PLoS ONE)學術編委和統計編委、《腦成像方法前沿》(Frontiers in Brain Imaging Methods)評審編委;NeuroImage, Human Brain Mapping, Journal of Neuroscience, Archives of General (JAMA) Psychiatry, American Journal of Psychiatry, Biological Psychiatry,Neuroscience & Biobehavorial Reviews等30余個專業期刊審稿人;荷蘭Marie Curie國際基金、A-star新加坡國立大學-美國杜克大學聯合基金評審專家、英國醫學研究理事會(MRC)基金評審專家;目前主持國家自然科學基金面上項目、國際重大合作項目、中國科學院重點部署項目和中國科學院儀器設備功能開發技術創新項目各一項。詳細信息請參見課題組網站:http://lfcd.psych.ac.cn/index.html 和http://scholar.google.com/citations?user=a3-gVGMAAAAJ&hl=en
 
      龔高浪,國家自然科學優秀青年基金獲得者,北京師范大學認知神經科學與學習國家重點實驗室研究員,博士生導師。2006年畢業于中科院自動化所,獲博士學位,2006-2010赴加拿大Alberta大學、Mcgill大學從事博士后研究,2011年至今在北師大認知神經科學與學習國家重點實驗室工作。榮獲scopus“青年科學之星”(生命領域),入選北京市科技新星計劃。主要從事基于結構與彌散磁共振神經影像的活體腦連接與腦網絡研究,已在本領域權威期刊(如Journal of neuroscience, cerebral cortex, neuroimage等 )發表SCI論文多篇,相關研究工作得到了國內外同行的廣泛關注和高度評價,發表論文已被SCI引用超過700次。獲批軟件著作權3項(如PANDA軟件),發明專利1項。 現任PLoS ONE學術編輯(academic editor),國家自然科學基金項目、中荷聯合科研主題(JSTP)項目評審專家,并擔任多個國際期刊審稿人,現承擔多項國家級科研項目(如國自然面上項目、科技部973(青年科學家項目)科研骨干、國家社科基金重大專項子課題負責人等)。
 
      夏明睿,博士,北京師范大學認知神經科學與學習國家重點實驗室科研助理。主要研究方向為靜息態腦功能網絡的計算方法,及其在神經精神疾病中的應用,腦網絡可視化等。在國際期刊發表SCI論文數篇,編寫了腦網絡繪制軟件BrainNet Viewer,下載量達5000余次,用該軟件繪制圖片的期刊封面文章5篇。曾獲認知神經科學與學習國家重點實驗室優秀學術成果獎、教育部博士研究生學術新人獎等。
 
      3.    課程安排 
20131121日(晚上7:00開始):warmup course
  • Step-by-step processing and analysis of R-fMRI data (Mingrui Xia&Xinian Zuo)
 
20131122日(上午8:30開始):
  • R-fMRI: biophysical mechanisms of BOLD imaging (Anthony Liu)
  • R-fMRI: introduction of resting-state BOLD fMRI (Yufeng Zang)
  • Multi-modal integration: R-fMRI and perfusion MRI (Anthony  Liu)
  • R-fMRI: pre-processing steps and relevant considerations (Xinian Zuo)
  • R-fMRI: local activity --method and applications to brain disorders and memory consolidation (Yufeng Zang)
  • R-fMRI: seed-based connectivity analysis--methods and applications  (Mingrui Xia)
  • Panel discussion: R-fMRI technique—experimental design and data analysis
 
20131123日:(830)
  • R-fMRI: ICA-based connectivity analysis --methods and applications (Xinian Zuo)
  • R-fMRI: graph-based network analysis--methods and applications (Yong He)
  • R-fMRI: studying cognition (Yanchao Bi)
  • R-fMRI: studying neuropsychiatric disorders (Fei Wang)
  • Panel discussion: R-fMRI connectivity analysis and applications
  • Student: Oral presentation
 
20131124日(下午400結束):
  • Multi-modal integration: R-fMRI and diffusion MRI (Gaolang Gong)
  • R-fMRI packages: analysis and visualization tools (Mingrui Xia)
  • How to write R-fMRI papers (Yong He)
 
以上報告均以中文授課
4.    備注
¨        培訓費:每人3000元(提供“培訓費”正式發票),包括培訓費、資料費、餐費; 交通及住宿費用自理。
¨        培訓地點:北京市圓山大酒店(北京市西城區裕民路2號)。
¨        學員住宿地點:北京市圓山大酒店  標準雙人間:300元/間/天(150元/人/天)
¨        全體學員于2013年11月21日下午在北京市圓山大酒店大堂集中報到,21日晚
上19:00開始上課,22-24日全天培訓,課程于24日下午4時結束。
¨        最終課程安排以報到當日發放的課程表為準。
¨        報名方法:電話或電子郵件均可,最好以電話確認。
¨        培訓班限額招生,為便于會務安排,報名敬請從速。
¨        報名截至日期:2013年11月10日
為便于會務安排,報名敬請從速!
   北京報名點:
   聯系人:周丹 
           聯系電話: 13683079540
          Email: zhoudan@sinorad.com
 
    深圳報名點:
            聯系人:應敏 
            聯系電話: 13632680220
            Email: yingmin@sinorad.com
 
 
交費方法:會議前銀行轉賬或現場交現金(現場不能刷卡)
如通過銀行匯款,請將學費匯至下列賬號(注明:2013北京fMRI培訓班):
戶 名:北京中科美德醫療信息科技有限公司
開戶行:中國建設銀行北京阜成路支行
賬 號:11001085400059610940
 
北京市圓山大酒店路線圖:
地址:北京市西城區裕民路2號
酒店聯系電話: 010-62023328,62010033
 
 



神經影像分析軟件培訓計劃survey
常用軟件及功能列表
  功能 領域
子領域
軟件名稱
功能簡述
 興趣 指數*
DTI
 
DTI studio
DTI Studio是一個在Windows下運行的擴散張量圖像后處理程序。適合張量計算,顏色映射,白質纖維束跟蹤,三維可視化等任務。
 
MedInria
MedINRIA是由法國INRIA開發的醫學影像后處理平臺。包含醫學影像可視化,DTI纖維束跟蹤與張量顯示,圖像配準,多硬化癥分析,腦溝回可視化等功能。
 
FSL
FSL偏重于DTI的統計學處理分析。
 
TBSS
TBSS是FSL軟件下的一個DTI數據處理工具,主要用于比較不同組人群之間局部FA或其他DTI參數的差異,與VBM或VBA比較相近,但所使用的算法完全不同,是目前DTI數據中比較常用的軟件之一。
 
TrackVis
TrackVis是一款多平臺DTI數據處理軟件,可以在Windows系統或Linux系統下使用,可用于計算計算纖維束走形和顯示非常方便的軟件。該軟件由兩個工具箱構成,Diffusion Toolkit用于計算DTI或HARDI數據以及常用的各參數,如ADC、FA、本征值等。TrackVis用于對計算出的神經纖維束顯示和分析,可以手工畫ROI或VOI也可以通過導入ROI或VOI進行纖維束追蹤,并可分析通過ROI的纖維束數目及長度等信息。是目前比較好用的一款DTI數據處理軟件,上手比較容易。
 
腦結構連接分析
PANDA
PANDA是基于FSL等軟件開發的dMRI數據處理軟件。它可以全自動地對大量的被試進行預處理,并產生用于voxel-based、atlas-based和TBSS-based統計分析所需的數據;此外可以通過確定性追蹤和概率追蹤進行網絡構建。軟件可以同時并行分析大批量的數據。(www.nitrc.org/projects/panda/)
 
fMRI
靜息態fMRI
REST
REST是一個靜息態功能磁共振數據分析工具,可以計算功能連接(FC),區域同質性(ReHo值),振幅低頻率波動(ALFF),Granger因果分析(GCA)等指標。同時包含豐富的圖像分析工具,如各種統計分析、可視化,多重比較校正,時間序列提取,結果出圖等。
 
FSL - MELODIC
FSL MELODIC 3.0是牛津大學開發的一個功能磁共振后處理軟件。該方法無需指定任何先驗模型,憑借獨立分量分析(ICA)將單個或多個四維數據集分解成不同的空間和時間組件,從而尋找活躍區域。
 
GIFT
基于Matlab的專門用來做ICA分析的工具包,可以用來進行基于任務fMRI和靜息fMRI的ICA分析及其后續分析。
 
MICA
基于Matlab的易于操作的ICA分析軟件。可以實現較大樣本量數據的ICA分析,通過多次運算求得穩定的ICA分析結果,克服ICA分析的不穩定性。
 
DPARSF(A)
流水線式自動化的fMRI和靜息態fMRI數據預處理,靜息態fMRI數據后處理工具包。可以實現目前主流的各種靜息態fMRI指標的計算??梢詫崿F并行的快速計算。
 
任務態fMRI
SPM
SPM是分析功能成像數據教主流的一個軟件包??梢苑治龆喾N腦成像數據,包括fMRI,PET,SPECT,EEG和MEG。
 
GLM Flex
基于Matlab和SPM的二次統計(組分析)分析軟件,除了SPM包括的那些簡單模型(單樣本,雙樣本t檢驗等),還允許更多功能如mixed ANOVA,2×2被試內設計,多于兩因素的ANOVA分析。
 
FSL-FEAT
FSL FEAT基于模型的fMRI數據分析軟件, FEAT對于實驗設計和分析具有很高的靈活性,適合于復雜的功能磁共振實驗設計任務。
 
AFNI
AFNI是在linux上運行的分析功能成像數據的工具集。可以分析多種腦成像數據,包括fMRI,PET,SPECT等。
 
 
LISREL
LISREL (Linear Structural Relations)是由K.G. Joreskog & D. Sorbom所發展的結構方程模型 (Structural Equation Modeling)軟件. LISREL被認為是最專業的結構方程模塊(Structural Equation Modeling, 簡稱 SEM )分析工具,通過fMRI數據可以對大腦進行網絡模型構建(帶有方向性),并對所做模型供驗證性因素分析。由于LISREL在探討多變項因果關系上的強力優勢,最早LISREL運用于社會學研究,最近隨著腦科學研究的進展也有不少研究人員將結構方程模型運用于大腦網絡的研究進而探討多變項或單變項之間的因果關系。
 
Structural MRI
皮層
Freesurfer
FreeSurfer是哈佛大學開發的磁共振神經影像分析,主要用于測量大腦皮層的厚度和統計分析。
 
溝回
BrainVISA
BrainVISA 可以用來分析T1加權大腦MR圖像,包括灰/白質分類,左右半球表面的提取與可視化,大腦皮質溝回的提取、標記等。
 
結構
SPM
測腦體積、VBM、及其他
 
多模態磁共振數據分析
腦網絡分析
GRETNA
GRETNA是一個針對磁共振影像數據開發的基于圖論的復雜腦網絡分析軟件。該軟件可以對腦功能影像進行自動預處理,并能批量計算常用的二值化或者加權腦網絡的拓撲屬性,如類聚系數、最短路徑長度、小世界屬性、網絡效率、模塊化、節點度、節點介數、節點效率等,并能對結果進行統計分析(www.nitrc.org/projects/gretna)
 
腦網絡可視化
BrainNet Viewer
BrainNet Viewer是一個腦網絡可視化軟件,提供了豐富的設置來幫助研究者快速、靈活、方便地展示腦連接網絡的信息。該軟件支持顯示基于圖論的三維腦網絡模型以及體數據到三維腦曲面的映射,并能夠將顯示結果保存成常用的圖片格式或制作展示電影動畫(www.nitrc.org/projects/bnv/)
 
多功能平臺
3D slicer
3D Slicer是一個開放式的醫學影像后處理平臺,可以創建特定主題的醫學圖像分析和可視化工具。包含
多種模態成像如MRI,CT,超聲,核醫學等,可以分析從頭部到腳的多個器官影像,具有較好的可擴展性。
 
 
FSL
測體積、VBM、及其他
 
 
*興趣指數:1-5:  1=最不想學,5=最想學




 
第九屆功能磁共振影像(fMRI)
---靜息態fMRI技術及應用專題培訓班(2013.11.21-24 中國?北京)


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